四川省疾病预防控制中心 关于购买食品安全风险监测相关菌株全基因组测序服务的比选公告

07.05.2021  21:50

各参选企业:

        我中心因工作需要,需购买食品安全风险监测相关菌株全基因组测序服务,完成基因组框架图测序,研究其传播规律。相关要求如下:

一、企业资质要求

(一)投标人须提供以下资质材料:

            1、三证合一的营业执照[副本] 复印件;

            2、法人代表授权书原件及被授权人的身份证复印件;

(二)投标人须提供如下承诺函原件:

          1、具有独立承担民事责任的能力的合法供应商;

          2、具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;

          3、具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;

          4、近三年内在经营活动中没有重大违法记录;

          5、具备履行合同所必需的设备和专业技术能力的证明材料;

二、项目预算

          项目预算:35万元,数量:大于等于1750株。

三、项目内容要求

          项目技术要求

          1、检测设备技术要求

          (1)测序读长:利用二代测序平台,平均测序读长为200~300bp,最长不可超过350bp;

          (2)准确度:数据准确度需Q30(99.9%)>85%;

          (3)覆盖度:碱基类型分布均匀,无GC分离;平均覆盖度 99.5%以上

          2、数量要求

          (1)PE150(双端测序,单向读长150bp)及以上测序;

          (2)原始数据量(碱基数)≥1.5G;

          (3)Q20高质量数据量(Clean data)≥1G

          3、测序质量要求

          (1)基因组覆盖度≥95%,基因区覆盖度≥98%,整体覆盖深度≥100×;

          (2)碱基数据质量值Q30比例≥85%,SCAFFOLD数量<100个,Contig数量<200个,单碱基错误率低于十万分之一。

          4、质控要求

          (1)文库上机质控标准

            构建好的文库使用Agilent 2100 Bioanalyzer和ABI StepOnePlus Real-Time PCR System进行质量和产量的检测。

            (2)测序数据质控

            下机数据的质控:正常PF比例:DNA >=85% ; Q20≥95% ;小片段文库clean data占raw data的80%-90%

          5、运行环境要求

          测序平台完成ISO系列资质认证(ISO9001、CLIA证书等)。

四、商务要求

          1、服务时间:

          2021年12月底前完成。

          2、付款方式:项目完成后一次性付全款

          ★3、安全保密要求(在响应文件出具相应承诺函)

          成交供应商应遵守国家法律法规,高度重视安全保密工作,成交供应商须与采购人签署保密协议,保密协议中应包含且不局限下述内容:

          不透露采购人及采购人系统中的数据信息;

          不透露采购人系统的配置、设置及其他与系统有关的信息。

4、项目周期要求

          按照项目系统的设计要求,项目执行工作拟分为DNA质控、DNA文库构建、上机信息采集、数据处理等几个阶段,每批样品数据反馈不超过30天。执行单位应根据项目总体的进度安排,做好项目的进度计划、安排,在保证系统总体质量的前提下做好项目总体进度控制。

5、项目产权要求

          在本项目所产生的技术成果(测序序列等)的全部知识产权归四川省疾病预防控制中心所有。项目结束时项目执行单位应提交项目执行的所有文档(包括文字资料和电子文件)。项目执行单位未经四川省疾病预防控制中心许可,不得在本项目以外使用。

6、项目验收

          在总数据量达标的情况下(1G),利用fastQC系统检查每个文库数据量不低于目标数据量的90%,平均Q20≥95% ,平均Q30≥85%。

          加★号条款为为实质性条款,实质性变动的内容,须经磋商小组中的采购人代表确认;实质性条款如未响应,其响应文件作无效响应处理。

五、材料报送要求

     请参与评选的企业带上相关资质及报价(盖鲜章,密封文件)于2021年5月17日9:00—10:30交至四川省疾病预防控制中心(成都市中学路6号)行政楼510室谢老师处(可邮寄),过时不再接受材料报送。                 

          咨询电话:唐老师 028-85582528

四川省疾病预防控制中心

                                              2021年5月6日