四川省疾病预防控制中心 关于紧急采购高通量测序系统和现场测序仪的比选公告

09.02.2021  21:32

 

各参选企业:

  我中心需紧急采购高通量序系统1台和现场测序仪2台,欢迎符合要求的企业积极参与评选,评选要求如下:

一、参与企业资质要求

  1、企业营业执照(三证合一)复印件

  2、法定代表人身份证明材料复印件;

  3、法定代表授权书原件及被授权人身份证复印件;

  4、具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度承诺函;

  5、具有依法缴纳税收和社会保障金的良好记录承诺函;

  6、具有履行合同所必需的设备和专业技术能力承诺函;

  7、近三年内在经营活动中没有重大违纪记录承诺函;

二、项目预算及评选方式

  1、项目预算:高通量测序系统1台 总价:350万元;现场测序仪2台 总价:70万元。

  2、比选方式:项目采用综合评分法,评分细则详见附件。

三、项目要求

  (一)高通量测序系统

  1 设备用途

  1.1该系统将用于未知物种全基因组测序、已知物种再测序、全基因组小RNA分析、微生物宏基因组分析、病毒基因组变异研究、甲基化研究、转录组分析等;

  1.2 可用于不明原因感染、高热等疫情的快速应对;

  1.3 可用于冠状病毒的检测、鉴定和分型;

  1.4 可用于流感疫情的检测、鉴定和分型;

  1.5 可用于对病原微生物(如冠状病毒)的进化变异研究、毒力基因研究、耐药基因研究;

2 技术参数:

    2.1 二代测序仪:

  2.1.1 高通量数据平台:每次反应可生成3000亿(300G)碱基数据;

  2.1.2 高通量数据平台数据读取模式:单端读取序列和双端读取序列;

  2.1.3 读长2x150 bp时,整个测序运行完成时间:≤30小时;

  2.1.4 平台数据读长:单端读取序列,读长不低于150个碱基;双端读取序列:读长不低于2x150个碱基;

  2.1.5 从核酸到可测序文库样本的处理过程,无需进行emulsion PCR反应;

  2.1.6 测序文库上样后,整个测序过程无需手工操作,有效降低操作复杂性,减少实验误差;

  2.1.7 全封闭检测室,集成式测序卡盒,无需手工配制。卡盒内包括测序试剂、流路和废液回收容器,简化了文库上样和测序的操作,减少生物污染;

  2.1.8 试剂槽:即插即用,具备可读取的无线射频识别标签;

  2.1.9 测序数据准确性:测序结果给出严格的Q30质量数据,当2 × 150 bp测序时,Q30值≥75%;

  2.1.10 测序系统主机内置服务器,主机同时具备样本文库克隆扩增、测序和数据分析功能;

  2.1.11 仪器主机内不含液流流路,免日常冲洗维护工作;

  2.1.12 通过机器内置生物信息分析和FPGA加速模块,2小时内完成全部下机数据的基因组分析;

  2.1.13 机载生物信息学分析软件:可提供准确的超快速二级分析方案。采用优化的硬件加速算法,用于各种基因组分析解决方案,包括BCL-to-fastQ 转换、基因组定位、序列比对、序列排序、重复标记和变异检出;

  2.2 宏基因组病原鉴定、抗性基因和毒力基因分析系统:

  2.2.1 功能:该系统将用于未知物种全基因组测序、微生物宏基因组分析,可用于不明原因感染、不明原因明确症状的病原筛查,以及筛查过后的抗性基因毒力基因检测;可用于突发和新发疫情、卫生应急、食物中毒的快速应对,快速检测致病源,辅助设计治疗方案,建立抗性基因监察靶标;

  2.2.2 可兼容二代测序和三代测序的下机数据;

  2.2.3 从下机数据到结果报告仅需一键式操作,无需专业生物信息学知识;

  2.2.4 具有变异扩增防错技术;

  2.2.5 可自动计算覆盖度和深度,有效去除假阳性;

  2.2.6 2GB大小的测序数据2h内完成分析;

  2.2.7 可同时检测≥8000种病毒,≥9000种支原体和细菌,≥1000种真菌和寄生虫;

  2.2.8 提供系统资源占用统计功能,结果数据的reads数目做图统计功能,相对reads做图统计功能,拼接结果统计功能,样本物种谱鉴定功能,抗性基因分布统计功能,抗性基因差异及多态性统计功能,毒力基因分布统计功能等等;

  2.2.9 软件内嵌服务器,软硬件完美搭配,计算能力高效;

  2.2.10 内含300多种常见病原注释信息,并且用户可自定义加入病原,有利于常见病原的识别

  2.2.11 提供结果报告图片和病原拼接结果的导出功能;

3 配置要求

  3.1 高通量测序仪主机:1台;

  3.2 测序仪内置操作分析软件:1套;

  3.3 宏基因组病原鉴定、抗性基因和毒力基因分析系统:1套。

  3.4 8通道微量核酸定量荧光计

  3.5 配套建库试剂96人份,上机试剂2套

(二)现场测序仪

  1、技术参数:

  1.1*单次读长最长可达≥2.0百万碱基;

  1.2*一体化设计,由测序芯片槽、计算模块和屏幕集成一体,便携设计,方便携带到野外使用。

  1.3*无需联网也可以使用。

  1.4测序过程及建库无需PCR扩增模板,可实现单分子测序,不会因为PCR产生测序误差;

  1.5测序通量:单次运行理论产出可达30Gb;

  单次测序准确度≥95%,30X准确度≥99.9%,40X准确度≥99.99%;

  1.6测序时长:0-64h内可随时中断测序,

  1.7*芯片可重复多次使用;

  1.8*运行通量:单次运行≥1张测序芯片;

  1.9可用于基因组DNA、cDNA和PCR产物以及其它方法捕获或者扩增的靶向测序;

  1.10核酸修饰检测:对核酸分子进行直接检测,可以直接进行DNA和RNA的甲基化修饰,可实现单分子测序,不会因为PCR产生测序误差

  1.11模板制备时最少DNA需要量:1ng;

  1.12系统可以实现对原始DNA进行单分子实时测序,便于最大程度排除系统误差并获得真实可靠的变异信息;

  1.13测序反应结果不受样本GC/AT含量影响,均匀覆盖整个样本基因组,可测定极端高GC(如CGG重复序列)或高AT含量区域(如poly-A区域);

  1.14可用于全长16S/18SrRNA测序进行微生物群落分析,极大改善宏基因组样品的分类精度;可用于转录组全长测序,测序结果无需拼接,可直接分析转录本可变剪切模式;

  1.15*最快建库时间≤10min

  1.16*可通过结合Barcode实现扩增子的多重测序,可提供≥96种Barcode序列。

  2.配置:测序仪主机:2套  测序芯片4张

四、履约、质保及付款方式

    本项目质保期3年,履约保证金5%,履约保证金在项目质保结束后全额无息退款。项目在验收合格后一次性付全款。

四、报价时间

  请参选企业于2021年2月23日上午9:00--11:00将资质要求7条、评分细则所需内容及项目报价(一并装订成册,密封盖公章)交至中学路6号行政楼510办公室谢老师处,过时不再接受材料报送。

评分细则.docx

                                                                            咨询电话:唐老师 85582528

                                                                                四川省疾病预防控制中心

     2021年2月9日