电子科大获国际基因工程机器设计竞赛金奖和“最佳植物合成生物学”单项奖

16.11.2017  03:23

  当地时间11月13日下午,2017年度国际基因工程机器设计竞赛(International Genetically Engineered Machine competition, iGEM)总决赛在美国波士顿海涅斯会议中心圆满落幕。代表电子科技大学参赛的实验队(UESTC-China)凭借“烟草降解土壤有机污染物1,2,3-TCP”项目,从全球313支队伍中脱颖而出,获得金牌,同时在众多合成生物学项目中首次荣获“最佳植物合成生物学”(Best Plant Synthetic Biology)这一单项最高荣誉,实现新突破。

斩获单项奖 实现新突破

  在2017iGEM全球总决赛的舞台上,汇集了来自牛津大学、海德堡大学、威廉玛丽大学等世界一流名校共计313支队伍同台竞技,其中中国队伍包括清华、北大、中科大、电子科大等98支。我校实验队(UESTC-China)参与竞争最为激烈的环境组的角逐,与明尼苏达大学、曼彻斯特大学、京都大学等名校一争高下。经过比拼,最终在14个track中决出108枚金牌,来自国内高校的26支队伍夺金,电子科技大学位列其中,这也是我校连续第三年夺金。

  该项竞赛共设置Best Plant Synthetic Biology、Best Applied Design、Best Education & Public Engagement等单项奖,实验队(UESTC-China)将“最佳植物合成生物学”单项奖(Best Plant Synthetic Biology)收入囊中。这是我校首次在iGEM全球总决赛中获得最佳单项奖。

独辟蹊径   不负初心

  今年学校派出各专业的16名学生参赛,在教练汤丽霞、张勇、郑雪莲等老师的带领以及研究生廖茜的指导下,攻坚克难完成了名为“植物降解1,2,3-TCP”(注:通过植物降解1,2,3-TCP这种有害的有机卤化物)的环境组参赛项目。

  UESTC-China队另辟蹊径,在教练的指导下进行大量的文献与资料收集,最终选择鲜有关注的有机卤化物污染这一课题。有机卤化物常被用于化工材料的生产,因其难降解、易渗透、致癌致突变而更容易对人体及环境造成危害,正是因为有机卤化物污染十分罕见,但影响重大,队伍以此着手,希望通过这个项目引起更多人对有机卤化物的重视。

  早在2013年,我校iGEM参赛队就以降解卤代烷烃为目标,将DhaA、HheC两种酶的基因导入到底盘生物大肠杆菌的体内使其表达,以此来达到降解目的。但是今年,队伍将底盘生物改为双子叶植物烟草,同时插入第三个基因:EchA,最终实现将1,2,3-TCP降解为无毒无害的甘油。烟草种植面积可观、易运输、应用性强,而且我校生命学院对于烟草这种模式生物的研究比较有经验,在实验室和技术方面都能保证项目顺利完成。在此基础上,队伍为获得更高的降解效率,凭借蛋白质工程实验室得天独厚的优势,全面收集信息并不断推敲,探索更为优良的突变体,将前两个基因进行优化设计,最终得到了更为高效的突变体基因:DhaA31, HheC-W249P。

  在确定了底盘生物、基因元件以后,更多的实验操作是在代谢调控的基础上运用合成生物学的方法来构建最终的Super Tobacco。即使有成熟的技术体系及实验室基础做支撑,实验过程中也难免遇到难题,队长刘炳麟说:“在项目初期,载体构建一度陷入僵局,花费了大量的时间也不能获得阳性质粒”。为了使项目继续推进,多组队员参与构建,并和教练积极探讨,终脱离困境。半年时间内,没有暑假、没有周末,UESTC-China全体队员在实验室进行封闭式实验,先后攻克植物组培、阳性检测、产物分析、数学建模等技术难题,最终获得降解1,2,3-TCP为甘油的超级烟草。

  除了完成相关实验,队伍还走出学校、走进社会,开展土壤调研和科普展等相关活动,利用所学向广大群众宣传合成生物学知识,搭建起服务社会的桥梁。队伍还发明了“基因纸牌”并成功申请知识产权保护。

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  国际基因工程机器设计竞赛(iGEM)由美国麻省理工学院创办于2003年。比赛涉及生物学、计算机科学、数学等多学科,是以合成生物学为核心的多学科交叉国际级科技竞赛,其理念在于鼓励青年学生积极创新,用创新去改变世界。大赛组委会根据项目前沿性、创造性和完整性颁发金银铜奖牌。在教务处的大力支持下,我校iGEM专项赛事队伍于2013年成立,近年来屡次在大赛中摘金。

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